Theo đó, Ban Quản lý Khu kinh tế và Khu công nghiệp tỉnh Khánh Hòa được thành lập trên cơ sở hợp nhất Ban Quản lý Khu kinh tế Vân Phong tỉnh Khánh Hòa và Ban Quản lý các khu công nghiệp tỉnh Ninh Thuận.

Ban Quản lý Khu kinh tế và Khu công nghiệp tỉnh Khánh Hòa (sau đây gọi tắt là Ban Quản lý) là cơ quan trực thuộc UBND tỉnh Khánh Hòa, thực hiện chức năng quản lý Nhà nước trực tiếp đối với các khu công nghiệp, khu kinh tế trên địa bàn tỉnh Khánh Hòa; quản lý và tổ chức thực hiện chức năng cung ứng dịch vụ hành chính công và dịch vụ hỗ trợ khác có liên quan đến hoạt động đầu tư và sản xuất, kinh doanh cho doanh nghiệp trong các khu công nghiệp, khu kinh tế theo quy định của pháp luật.

Ban Quản lý có tư cách pháp nhân; có tài khoản, con dấu mang hình Quốc huy; kinh phí quản lý hành chính Nhà nước, kinh phí hoạt động sự nghiệp của Ban Quản lý và vốn đầu tư phát triển do ngân sách Nhà nước cấp theo kế hoạch và nguồn kinh phí khác theo quy định của cơ quan Nhà nước có thẩm quyền.

Ban Quản lý thực hiện các nhiệm vụ, quyền hạn theo quy định của pháp luật hiện hành.

Trưởng ban Ban Quản lý trình UBND tỉnh Khánh Hòa quy định cụ thể chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn và cơ cấu tổ chức của Ban Quản lý theo quy định của pháp luật.

Quyết định này có hiệu lực thi hành kể từ ngày ký ban hành 21/7/2025; bãi bỏ Quyết định số 998/QĐ-TTg ngày 24/7/2006 của Thủ tướng Chính phủ về thành lập Ban Quản lý Khu kinh tế Vân Phong tỉnh Khánh Hòa; Quyết định số 719/QĐ-TTg ngày 7/6/2007 của Thủ tướng Chính phủ thành lập Ban Quản lý các khu công nghiệp tỉnh Ninh Thuận.