Theo dự thảo Đề án, việc sắp xếp thực hiện theo nguyên tắc: Hợp nhất cơ quan tham mưu, giúp việc chung với cơ quan MTTQ; giữ nguyên tư cách pháp nhân của các tổ chức chính trị-xã hội, hội quần chúng (có con dấu, tài khoản riêng).

Cụ thể, thứ nhất, sắp xếp toàn bộ các ban, đơn vị tham mưu giúp việc của cơ quan Ủy ban MTTQ Việt Nam và các tổ chức chính trị -xã hội thành phố về trực thuộc Ủy ban MTTQ Việt Nam thành phố để tham mưu, giúp việc chung, theo định hướng...

Thứ hai, đối với đơn vị sự nghiệp thuộc khối giáo dục - đào tạo, giai đoạn 1: Chuyển giao Trường Trung cấp nghiệp vụ và dạy nghề Công đoàn Hà Nội (thuộc Liên đoàn Lao động thành phố), về trực thuộc cơ quan Ủy ban MTTQ Việt Nam thành phố; giai đoạn 2: Thực hiện chỉ đạo của cấp có thẩm quyền, tiếp tục chuyển giao Trường Trung cấp nghiệp vụ và dạy nghề Công đoàn Hà Nội về cơ quan quản lý Nhà nước có liên quan.

Đối với đơn vị sự nghiệp thuộc khối báo chí, Tổ soạn thảo lựa chọn phương án, đó là: Trong giai đoạn 1, chuyển giao 3 báo là Báo Lao động Thủ đô (đang thuộc Liên đoàn lao động thành phố), Báo Tuổi trẻ Thủ đô (thuộc Thành Đoàn Hà Nội), Báo Phụ nữ Thủ đô (thuộc Hội Liên hiệp Phụ nữ thành phố) về trực thuộc cơ quan Ủy ban MTTQ Việt Nam thành phố Hà Nội.

Giai đoạn 2, sau khi Đề án sáp nhập các cơ quan báo chí, phát thanh, truyền hình thành phố thành 1 cơ quan báo chí của Đảng ủy UBND thành phố được cấp có thẩm quyền thông qua, Đảng ủy Ủy ban MTTQ Việt Nam thành phố sẽ phối hợp, chuyển giao các cơ quan báo chí trên để thực hiện sắp xếp, sáp nhập.

Thứ ba, thành lập Trung tâm Tư vấn pháp luật, hỗ trợ vay vốn và dịch vụ việc làm trực thuộc cơ quan Ủy ban MTTQ Việt Nam thành phố trên cơ sở hợp nhất các đơn vị sự nghiệp công lập trực thuộc các tổ chức chính trị-xã hội.

Thứ tư, các đơn vị sự nghiệp công lập, đơn vị kinh tế trực thuộc các tổ chức chính trị-xã hội thành phố còn lại về trực thuộc cơ quan Ủy ban MTTQ Việt Nam thành phố gồm: Cung Văn hóa lao động hữu nghị Việt - Xô; Nhà nghỉ Công đoàn Hà Nội; Quỹ trợ vốn công nhân, viên chức, lao động nghèo Thủ đô phát triển kinh tế gia đình; Công ty TNHH NN MTV Du lịch công đoàn Hà Nội; Công ty TNHH MTV Kinh đô; Cung Thanh niên Hà Nội; Cung Thiếu nhi Hà Nội; Trường Lê Duẩn; Trung tâm Tư vấn pháp luật, hỗ trợ vay vốn và dịch vụ việc làm.

Về tổ chức Đảng, thành lập Đảng bộ MTTQ Việt Nam thành phố Hà Nội là Đảng bộ cơ sở trực thuộc Đảng bộ các cơ quan Đảng thành phố.