Đoàn thanh tra gồm 11 người do ông Ngô Đình Long, Phó Vụ trưởng Vụ Thanh tra, Giải quyết khiếu nại, tố cáo khối văn hóa, xã hội (Vụ III), Thanh tra Chính phủ làm Trưởng đoàn có trách nhiệm thanh tra trách nhiệm trong việc thực hiện cơ chế tự chủ giai đoạn 2016 - 2022 tại Viện Hàn lâm Khoa học và Công nghệ Việt Nam. Thời kỳ thanh tra từ ngày 1/1/2016 đến ngày 31/12/2022; khi cần thiết có thể xem xét trước hoặc sau thời kỳ nêu trên.

Thời hạn thanh tra là 60 ngày làm việc thực tế (không kể ngày nghỉ, ngày lễ) kể từ ngày công bố quyết định thanh tra.

Theo kế hoạch, đoàn sẽ tiến hành thanh tra đối với 8 tổ chức khoa học công nghệ công lập, đơn vị sự nghiệp công lập thuộc Viện Hàn lâm Khoa học và Công nghệ Việt Nam. Tùy tình hình thực tế, trong quá trình thanh tra, Thanh tra Chính phủ sẽ thông báo khi có sự thay đổi hoặc bổ sung đơn vị được kiểm tra, xác minh.