Cục Thuế Thanh Hóa đã kết luận, Công ty Mai Hải đã mở sổ sách kế toán, phản ánh các nghiệp vụ kinh tế phát sinh và lập báo cáo tài chính theo quy định. Tuy nhiên, Công ty Mai Hải đã kê khai sai thuế giá trị gia tăng đầu vào được khấu trừ của các tháng 2/2023, tháng 8/2023 làm tăng số thuế phải nộp tháng 7/2023 và làm giảm số thuế còn được khấu trừ cuối kỳ kê khai tháng 12/2023. Xác định sai chi phí được khấu trừ khi tính thuế thu nhập doanh nghiệp, dẫn đến làm thiếu số thuế thu nhập doanh nghiệp năm 2023.

Các hành vi vi phạm trên của Công ty Mai Hải đã vi phạm quy định tại điểm a, Điều 24, khoản 1, 2,3 Điều 16 Nghị định số 125/2020/NĐ-CP ngày 19/10/2020 của Chính phủ quy định về xử phạt vi phạm hành chính về thuế, hóa đơn.

Từ những kết quả vi phạm này, Cục Thuế Thanh Hóa đã phạt vi phạm hành chính 80.461.919 đồng đối với Công ty Mai Hải do khai sai dẫn đến thiếu số thuế thu nhập doanh nghiệp, trong đó phạt hành vi kê khai dẫn đến thiếu số thuế thu nhập doanh nghiệp phải nộp 71.781.636 đồng; phạt hành vi lập hóa đơn không đúng thời điểm (3 tình tiết tăng nặng) 19.800.000 đồng; phạt vi phạm kê khai sai nhưng không phát sinh thuế giá trị gia tăng phải nộp 6.500.000 đồng.

Các biện pháp khắc phục hậu quả, Cục Thuế Thanh Hóa truy thu thuế thu nhập doanh nghiệp 217.389.999 đồng; truy thu thuế giá trị gia tăng 10.018.180 đồng; tiền chậm nộp tiền thuế giá trị giá trị gia tăng 1.057.920 đồng; tiền chậm nộp tiền thuế thu nhập doanh nghiệp 8.347.776 đồng. Tổng số thuế truy thu, phạt hành chính và tiền chậm nộp là 308.595.510 đồng.

Cục Thuế Thanh Hóa yêu cầu Công ty Mai Hải nộp số tiền thuế truy thu, tiền phạt vi phạm hành chính và tiền chậm nộp tiền thuế vào tài khoản 7111 cơ quan thu Chi cục Thuế Khu vực TP Thanh Hóa - Đông Sơn mở tại Kho bạc Nhà nước tỉnh Thanh Hóa khi có quyết định xử lý của Cục Thuế tỉnh Thanh Hoá.