Kết luận thanh tra số 39 /KL-TCT ngày 25/11/2024 của Tổng cục Thuế cho thấy, đối với việc kê khai, nộp thuế và chấp hành pháp luật thuế, qua thanh tra phát hiện, việc kê khai thuế, nộp thuế, công ty đã đăng ký, kê khai và nộp thuế giá trị gia tăng (GTGT), thu nhập doanh nghiệp (TNDN), thu nhập cá nhân (TNCN) theo quy định. Tuy nhiên, trong quá trình thực hiện còn phát sinh một số sai sót về việc kê khai, nộp thuế phải điều chỉnh.

Về thuế GTGT, qua thanh tra, số thuế GTGT phải nộp trong kỳ thanh tra tăng số tiền trên 316 triệu đồng do công ty kê khai chưa đúng theo hướng dẫn tại Điều 81 Thông tư 200/2014/TT-BTC ngày 22/12/2024 của Bộ Tài chính; quy định tại Điều 11 Thông tư số 219/2013/TT-BTC ngày 31/12/2013 của Bộ Tài chính (đã được sửa đổi, bổ sung tại Khoản 3, Điều 1 Thông tư số 26/2015/TT-BTC ngày 27/2/2015 của Bộ Tài chính); khoản 10 Điều 1 Thông tư số 26/2015/TT-BTC ngày 27/2/2015 sửa đổi, bổ sung Điều 15 Thông tư số 219/2013/TT-BTC ngày 31/12/2013 của Bộ Tài chính, cụ thể: Năm 2022 trên 283,8 triệu đồng và năm 2023 trên 32,2 triệu đồng.

Về thuế TNDN, qua thanh tra, số thuế TNDN phải nộp trong kỳ tăng số tiền trên 663 triệu đồng do công ty kê khai chưa đúng theo hướng dẫn tại Điều 4 Thông tư số 96/2015/TT-BTC ngày 22/6/2015 sửa đổi, bổ sung Điều 6 Thông tư số 78/2014/TT-BTC ngày 18/6/2014 của Bộ Tài chính; Điều 81 Thông tư 200/2014/TT-BTC ngày 22/12/2024 của Bộ Tài chính; Khoản 9 Điều 9 Thông tư 45/2013/TT-BTC ngày 25/4/2013 của Bộ Tài chính.

Trong đó, năm 2021 gần 320 triệu đồng; năm 2022 trên 278,6 triệu đồng và năm 2023 trên 64 triệu đồng.

Qua kết quả thanh tra, Tổng cục Thuế yêu cầu công ty nộp ngay khoản tiền thuế truy thu, tiền phạt vi phạm hành chính và tiền chậm nộp tiền thuế vào ngân sách Nhà nước khi có quyết định xử phạt vi phạm hành chính của Tổng cục Thuế, cụ thể:

Xử phạt vi phạm hành chính về thuế quy định tại Điểm a khoản 1 Điều 16 Nghị định số 125/2020/NĐ-CP ngày 19/10/2020 của Chính phủ quy định xử phạt vi phạm hành chính về thuế, hóa đơn; khoản 3 Điều 16 Nghị định số 125/2020/NĐ-CP ngày 19/10/2020 của Chính phủ quy định xử phạt vi phạm hành chính về thuế, hóa đơn.

Công ty bị Tổng cục Thuế áp dụng các hình thức xử phạt, biện pháp khắc phục hậu quả, phạt tiền trên 238 triệu đồng, trong đó phạt hành vi khai sai dẫn đến thiếu số tiền thuế phải nộp (theo tỷ lệ 20% trên số thuế phải nộp tăng thêm) trên 195,8 triệu đồng; phạt hành vi khai sai không dẫn đến thiếu số tiền thuế phải nộp, số tiền trên 42 triệu đồng.

Tổng cục Thuế buộc công ty nộp đủ số tiền thuế truy thu do kê khai sai, số tiền trên 979 triệu đồng, trong đó, thuế GTGT trên 316 triệu đồng (năm 2022 trên 283,8 triệu đồng và năm 2023 trên 32,2 triệu đồng); thuế TNDN trên 663 triệu đồng (năm 2021 gần 320 triệu đồng; năm 2022 trên 278,6 triệu đồng và năm 2023 trên 64 triệu đồng); tiền chậm nộp tiền thuế, số tiền trên 228,7 triệu đồng.

Số tiền chậm nộp tiền thuế nêu trên được tính đến hết ngày 18/11/2024. Công ty có trách nhiệm tự tính và nộp số tiền chậm nộp tiền thuế kể từ sau ngày 18/11/2024 đến ngày thực nộp số thuế truy thu, tiền phạt, tiền chậm nộp vào Ngân sách Nhà nước.

Tổng cục Thuế yêu cầu công ty điều chỉnh số liệu kê khai thuế theo kết quả thanh tra, chấn chỉnh công tác quản lý tài chính và kê khai, nộp thuế theo quy định của pháp luật hiện hành.

Tổng cục Thuế giao Chi cục Thuế thành phố Thuận An - Bình Dương có trách nhiệm hướng dẫn, đôn đốc công ty rà soát số liệu thanh tra, kê khai thuế, điều chỉnh nộp đầy đủ, kịp thời số tiền thuế truy thu, tiền phạt và tiền chậm nộp tiền thuế vào ngân sách nhà nước theo quyết định xử phạt vi phạm hành chính về thuế qua thanh tra của Tổng cục Thuế và thực hiện kiến nghị tại kết luận thanh tra của Tổng cục Thuế và Biên bản thanh tra ký ngày 18/11/2024 theo đúng quy định.

Phối hợp với công ty rà soát, đối chiếu số nộp ngân sách Nhà nước nhằm phản ánh kịp thời, chính xác tình hình thực hiện với nghĩa vụ ngân sách Nhà nước.