Theo đề án, thành lập Sở Dân tộc và Tôn giáo Nghệ An (trên cơ sở Ban Dân tộc tỉnh tiếp nhận chức năng, nhiệm vụ, tổ chức bộ máy tham mưu quản lý Nhà nước về tôn giáo từ Sở Nội vụ) đảm bảo cơ cấu bộ máy tinh gọn, hợp lý, hiệu lực, hiệu quả, đáp ứng yêu cầu hoạt động của sở tham mưu quản lý nhà nước đa ngành, đa lĩnh vực gắn với việc hoàn thiện, xác định rõ chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn; cơ cấu lại, tinh gọn và nâng cao chất lượng cán bộ, công chức, viên chức của sở, đáp ứng yêu cầu nhiệm vụ trong tình hình mới.

Số đầu mối của 2 cơ quan trước khi hợp nhất: gồm 5 phòng và tương đương; trong đó Ban Dân tộc tỉnh có 4 phòng và Ban Tôn giáo thuộc Sở Nội vụ (tương đương phòng thuộc sở).