Hiện tại, CTCP Cảng Cam Ranh là công ty con của Tổng Công ty Hàng hải Việt Nam - CTCP (VIMC, UPCoM: MVN). Trong thời gian Cục Thuế tỉnh Khánh Hòa kiểm tra từ ngày 1/1/2021 đến ngày 31/12/2022 đã phát hiện, CTCP Cảng Cam Ranh đã có hành vi khai sai căn cứ tính thuế và số tiền thuế được khấu trừ dẫn đến thiếu số tiền thuế giá trị gia tăng và thuế thu nhập doanh nghiệp phải nộp năm 2021 và 2022 với số tiền hơn 156,4 triệu đồng (nhưng các nghiệp vụ kinh tế đã được phản ánh đầy đủ trên hệ thống sổ kế toán, hóa đơn, chứng từ hợp pháp).

Với các hành vi nêu trên, Cảng Cam Ranh bị xử phạt hành chính với số tiền gần 31,3 triệu đồng. Biện pháp khắc phục hậu quả là CTCP Cảng Cam Ranh phải nộp đủ số tiền thuế truy thu hơn 156,4 triệu đồng và tiền chậm nộp thuế gần 41,9 triệu đồng. Tổng số tiền phạt và truy thu đối với CTCP Cảng Cam Ranh là gần 230 triệu đồng.