Theo đó, Bệnh viện Đa khoa huyện Vân Hồ sẽ gồm cơ sở 1 tên gọi là Bệnh viện Đa khoa huyện Vân Hồ - Cơ sở Vân Hồ có địa điểm tại xã Vân Hồ, huyện Vân Hồ, tỉnh Sơn La; quy mô 150 giường bệnh; bố trí, sử dụng cơ sở vật chất, trang thiết bị mới được đầu tư, xây dựng.

Cơ sở 2 tên gọi là Bệnh viện Đa khoa huyện Vân Hồ - Cơ sở Thảo Nguyên; địa điểm tại Tiểu khu Bệnh viện, thị trấn Nông trường Mộc Châu, huyện Mộc Châu, tỉnh Sơn La; quy mô 320 giường gồm toàn bộ cơ sở vật chất, trang thiết bị của Bệnh viện Đa khoa Thảo Nguyên huyện Mộc Châu hiện có.

Loại hình của đơn vị là cơ sở khám bệnh, chữa bệnh; đơn vị sự nghiệp công lập tự đảm bảo chi thường xuyên, trực thuộc Sở Y tế.

Bệnh viện Đa khoa huyện Vân Hồ tiếp tục được xếp hạng II cho đến khi thực hiện xếp hạng lại theo quy định; quy mô 470 giường bệnh.

Về vị trí, chức năng, Bệnh viện Đa khoa huyện Vân Hồ là đơn vị sự nghiệp trực thuộc Sở Y tế Sơn La, có chức năng cung cấp dịch vụ chuyên môn, kỹ thuật về khám bệnh, chữa bệnh, phục hồi chức năng và các dịch vụ y tế khác theo quy định của pháp luật.

Cơ cấu gồm Giám đốc và không quá 3 Phó Giám đốc; giữ nguyên 17 khoa phòng đang thực hiện và có 5 phòng chức năng.

Bệnh viện Đa khoa huyện Vân Hồ thực hiện cơ chế tự chủ tài chính.